集菌仪蠕动泵工作原理通俗易懂的理解就像用连两根手指一段一段捏挤一根装满液体的软管，手指向前滑动的时候，软管里面的液体也会随着手指的滑动向前流动。蠕动泵原理就和这个原理一样，只不过蠕动泵是利用了泵头里面的滚轮来替代了手指。

通过对泵的弹性输送软管交替进行挤压和释放来泵送流体。就像用两根手指夹挤软管一样,随着手指的移动,管内形成负压,液体随之流动.集菌仪的蠕动泵就是在两个转辊子之间的一段泵管形成“枕”形流体。“枕”的体积取决于泵管的内径和转子的几何特征。

集菌仪蠕动泵流量大小取决于泵头的转动速度与“枕”的尺寸大小、转子每转一圈产生的“枕”的个数这三项参数之乘积。“枕”的尺寸一般为常量（特殊情况除外，例如 输送粘度较高的流体）。拿转子直径相同的泵相比较，产生较大“枕”体积的泵，其转子每转一圈所输送的流体体积也较大，但产生的脉动度也较大。